本科毕业论文相似度检测的原理主要是通过文本比对算法来分析论文中的文字内容，检测其中是否存在重复、抄袭等情况。常用的方法包括基于规则的比对、基于语义的比对、基于机器学习的比对等。其中，基于机器学习的比对方法在实际应用中越来越受到重视，通过训练模型来识别论文中的相似度，提高检测的准确性和效率。

本科毕业论文相似度检测的常用方法包括查重系统、反抄袭系统等。查重系统通过比对论文文本内容的相似度来判断是否存在抄袭行为，常用的算法包括余弦相似度算法、Jaccard相似度算法等。反抄袭系统则是通过检测论文与已有文献的相似度，提供论文作者参考和引用的建议，帮助提高论文质量和学术水平。